第40集剧情:小宝打消回中原念头 韦小宝加官进爵
皇上对韦小宝既往不咎，让韦小宝回来参加他的大婚，皇上派韦小宝铲除天地会，再去打吴三桂(于荣光 饰)，就答应把建宁公主许配给他，韦小宝陷入两难。
韦小宝勉强接过圣旨，可心里已经打定主意要抗旨，他把张康年(海洋 饰)打发走，韦小宝向王进宝(付晓博 饰)说明心中的想法，他不能做不忠不义的人，拜托王进宝回去向皇上复命，否则他就以死谢罪，王进宝反而劝韦小宝，韦小宝兴之所至，请王进宝陪他赌掷骰子。建宁公主，阿珂和苏荃都即将临盆，她们疼得大呼小叫，韦小宝发誓做牛做马报答她们的大恩，双儿手忙脚乱帮她们三人接生，顺利生下三个小宝宝，韦小宝激动地说不出话来。、
不久之后，皇上派赵良栋(魏凯 饰)来海岛见韦小宝，不但没有治他的罪，反而加官进爵，建宁公主迫不及待想回京城，赵良栋只是奉命带人来保护韦小宝，还送来粮食和物资。韦小宝早已经厌烦了岛上枯燥的生活，主动提出带兵攻打吴三桂，皇上早就猜到韦小宝的心思，让他先铲除天地会，再去攻打吴三桂，韦小宝只好继续留在岛上。
赵良栋回京向皇上复命，皇上赌气让韦小宝困在海岛一辈子。韦小宝终日无所事事，他百无聊赖，他仰望漫天星辰，不由地想起皇上，心里百感交集，此时，皇上也在宫殿外枯坐，思念着远在海岛的韦小宝，直到困得睁不开眼睛，才回去休息。
转眼三年时间过去了，皇上派兵攻打吴三桂，很快把他打败，之后又派施琅(张磊 饰)进攻台湾，郑克爽不战而退，皇上终于完成收复台湾的心愿，他召集文武百官商量如何处置台湾问题，康亲王(魏健隆 饰)建议将当地的军民迁入内地，舍弃台湾这座孤岛，索额图(周帅 饰)赞成康亲王的想法，图海(许占伟 饰)不同意把银子浪费在这方面，明珠(田锋 饰)模棱两可，说不出切实可行的办法。皇上一时不知道该如何抉择，只好回来找太后(王秀竹 饰)商量，不知道派什么人处理台湾问题。
今天是九难(李舒桐 饰)的忌日，韦小宝来到坟前祭拜，向他哭诉在岛上无聊的生活，韦小宝每天吃鱼，他都快吐了。就在这时，施琅划着小船来给韦小宝传旨，皇上给韦小宝加官进爵，韦小宝得知皇上的心愿已了，他知道自己再也回不去了，只好来陈近南(王阳 饰)的坟前哭诉。
韦小宝得知施琅奉命要去台湾，就响彻你寄回把就能的遗体送回去，让他落叶归根，韦小宝热情地招呼施琅吃海鲜，建宁公主亲自给他上菜，施琅受宠若惊，韦小宝答应在皇上面前为他美言几句，他很快就会飞黄腾达，施琅感激不尽，当即决定向皇上请命，让韦小宝和他一起去台湾，建宁公主在一旁帮腔，口口声声称时间太久会引起别人对施琅的闲言碎语，施琅考虑再三，决定即刻带韦小宝去台湾。
韦小宝派人把陈近南的遗体抬到船上，他们一起踏上了去台湾的征途。韦小宝担心此次行程凶多吉少，就把建宁公主和孩子们安顿在直沽，苏荃和方怡愿意留下来保护建宁公主。施琅和韦小宝等人很快来到台湾的鹿耳门，官兵们夹道欢迎，还带来台湾的特色水果。
皇上得知施琅代合韦小宝去台湾了，他不由地心中暗喜。施琅接到京城来的密信，得知是皇上想吧台湾舍弃，担心外国人趁机进攻台湾，他连夜来找韦小宝求助，向韦小宝详细讲述了台湾的重要性，而且台湾几十万百姓也会不得安宁。
